در زمان امام على النقى7 مركز تشیع در ایران، قم بود و ارتباط تنگاتنگ و محكمى‌ میان شیعیان این شهر با ائمه وجود داشته است، به ویژه از محمّد بن داود قمى‌ و محمّد طلحى یاد شده كه از شهر قم اموال و اخبارى به امام مى‌‌‌رسانده‌اند. یكى از اتهاماتى كه بارها علیه حضرت امام على النقى7 مطرح شد، همین بود كه اموالى از مردم قم به دست آن حضرت مى‌‌‌رسد و امام با این اموال درصدد جمع آورى سلاح براى قیام علیه حكومت عباسى است.

از شهرهاى دیگر ایران كه شیعیان در آن فعال بودند مى‌‌‌توان از كاشان، نیشابور، گرگان و همدان و ... نام برد. [1]

[1]. رجال كشى، ص608 . خشونت و شدت عمل متوكل، منجر به بازداشت و دستگیرى شیعیان مى‌‌‌گردید و برخى از وكلاى امام به سبب همین خشونت ها، در بغداد، مدائن و كوفه و سایر نقاط عراق زیر شكنجه درگذشتند و عده‌اى دیگر به زندان افتادند.